2026-07-10T12:32:03.663Z https://vincere.fun/ Vincere Zhou Hexo https://vincere.fun/posts/9df7ea16/ 2026-07-10T12:03:43.000Z 2026-07-10T12:32:03.663Z

<p>crossmap 软件转基因组版本。</p>

https://vincere.fun/posts/57016660/ 2026-07-10T12:02:41.000Z 2026-07-10T12:04:44.446Z

<p><code>chain</code> 文件的格式由UCSC基因组浏览器定义。它的每一行都包含关于两个基因组版本（“目标” <code>t</code> 和 “查询” <code>q</code>）之间比对关系的详细信息。</p>

https://vincere.fun/posts/50085e7b/ 2026-07-10T12:01:44.000Z 2026-07-10T12:04:44.443Z

<p><strong>BED (Browser Extensible Data) 格式</strong>是一种广泛使用的、基于文本的基因组数据格式，用于定义和注释基因组上的特定区域。</p> <p>它最初由UCSC基因组浏览器（UCSC Genome Browser）为可视化基因组注释而开发，如今已成为生物信息学领域的实际标准。</p>

https://vincere.fun/posts/9d6bb500/ 2026-07-10T11:58:21.000Z 2026-07-10T12:04:44.448Z

<p>GO 和 KEGG 分析思路，包括模式生物、非模式生物的分析。总体来说，非模式生物还是很难确保能做 GO 和 KEGG 分析，一般必须同时有 OrgDb 数据库以及在 KEGG 官网上存在“三字母缩写”（但是好像哪怕存在“三字母缩写”，也可能其pathway相关信息是空的）。</p>

https://vincere.fun/posts/816a7470/ 2026-06-26T10:48:20.000Z 2026-06-26T10:50:11.691Z

<p>将 PDF 文件转换为 PNG 格式，在 R 和 Python 中都有很成熟的解决方案。这里我的目的是把 PDF 的一整页转为图片，而不是提取 PDF 中的图片。</p>

https://vincere.fun/posts/4aec5ad2/ 2026-06-26T10:47:06.000Z 2026-07-01T15:34:57.272Z

<p>康某森公司，快还我血汗钱！！！</p>

https://vincere.fun/posts/5765f179/ 2026-06-25T12:43:01.000Z 2026-06-25T12:45:07.950Z

<p>生成图片时矢量图和位图的选择。</p>

https://vincere.fun/posts/acf40c4e/ 2026-06-25T12:41:35.000Z 2026-06-25T12:45:07.947Z

<p>查看PDF的底层原理，已经为什么R 语言里的 <code>pdf()</code> 和 <code>cairo_pdf()</code> 内存占用不同。</p>

https://vincere.fun/posts/f1421d82/ 2026-06-24T09:08:08.000Z 2026-06-24T09:09:39.471Z

<p>网页中图表的图 n 这种编号进行自动编号的技术，这里采用 JS脚本实现。</p>

https://vincere.fun/posts/cc458b03/ 2026-06-24T09:07:12.000Z 2026-06-24T09:09:39.473Z

<p>如何使用 mathjax3 从而在 html 中插入 LaTeX 公式。</p>

https://vincere.fun/posts/a85fc5bd/ 2026-06-24T09:05:20.000Z 2026-06-25T08:22:41.000Z

<p>解决 R 画图输出 PDF 时中文无法正常显示的问题，深挖了一下，最终的思路是使用 <code>cairo_pdf</code>，而<code>showtext</code> 包作为备选方案。</p>

https://vincere.fun/posts/46111159/ 2026-06-17T09:14:18.000Z 2026-06-17T09:38:16.608Z

<p>HTML 的空白字符处理规则，<strong>连续的空白字符（换行+空格）会被折叠成 1 个空格</strong>。所以有时渲染的页面里会有一个多余的空格，你要是不介意也没事。</p>

https://vincere.fun/posts/a0d04094/ 2026-06-15T06:31:09.000Z 2026-06-16T09:04:49.000Z

<p>如题，记录一次网站崩溃事件和这个网站使用小结。</p>

https://vincere.fun/posts/ea2afea8/ 2026-06-12T06:23:36.000Z 2026-06-29T03:13:41.000Z

<p>网络版报告实现动态的关键 - python 包 jinja2 。</p>

https://vincere.fun/posts/e0ee8b5b/ 2026-06-12T06:21:53.000Z 2026-06-23T08:26:43.000Z

<p>JavaScript 基础学习。</p>

https://vincere.fun/posts/bac52e5b/ 2026-06-12T06:20:03.000Z 2026-06-12T06:30:57.961Z

<p>CSS 基础学习。</p>

https://vincere.fun/posts/37391f41/ 2026-06-12T06:18:29.000Z 2026-06-15T07:24:47.873Z

<p>HTML 基础学习。</p>

https://vincere.fun/posts/33b4171/ 2026-06-12T06:16:50.000Z 2026-06-12T06:30:57.947Z

<p>web开发基础：创建你的第一个网址。初步学习 HTML，CSS, JavaScript 的基础内容。</p> <p>在这一块，我不生产代码，我只是代码的搬运工。</p>

https://vincere.fun/posts/2a4baf3a/ 2026-06-12T06:14:59.000Z 2026-06-12T06:30:57.929Z

<p>用直接写markdown的形式生成 ppt 文件，至此完成了对 office 软件的扬弃。</p>

https://vincere.fun/posts/bef9d508/ 2026-06-12T06:07:45.000Z 2026-06-12T06:30:57.934Z

<p>机器学习做基因组选配文献笔记</p> <p>读了一篇用集成5种机器学习算法做基因组选配的文献，后代基因型通过亲本基因型模拟得到，每队亲本模拟2000个后代基因型，通过预测这2000个后代基因型的表型预测值的分布来判断是否选配。</p>