GS方法_GFBLUP

GFBLUP 也是 GBLUP 模型的一个变体,这里将加性效应拆分为了两个部分。

GFBLUP

GFBLUP (genomic feature best linear unbiased prediction) 其实就是将加性效应拆分为2个部分,模型如下

构建 G 阵方式如下

这里我们用 genomic feature 的位点和剩下的其余位点分别构建

最后加性效应就是这2部分之和。

genomic feature 解释的加性方差比例计算公式如下 (就是占加性效应方差的比例)

遗传力为

参考文献

  1. Edwards S M, Sørensen I F, Sarup P, et al. Genomic prediction for quantitative traits is improved by mapping variants to gene ontology categories in Drosophila melanogaster[J]. Genetics, 2016, 203(4): 1871-1883.
  • 版权声明: 本博客所有文章除特别声明外,著作权归作者所有。转载请注明出处!
  • Copyrights © 2019-2025 Vincere Zhou
  • 访问人数: | 浏览次数:

请我喝杯茶吧~

支付宝
微信